El Consejo de Dirección es la instancia máxima del premio. Define las características y lo convoca, nombra y remueve a los miembros del Jurado y determina su convocatoria y proclama los premios. Está integrado por los siguientes miembros:

• Presidente de la Generalitat de Catalunya, que ejerce la presidencia
PASQUAL MARAGALL MIRA

• Titular del Departamento que tiene competencias en investigación, que ejerce la vicepresidencia primera.
CARLES SOLÀ FERRANDO, Consejero de Universidades, Investigación y Sociedad de la Información

• Titular del Departamento que tiene competencias en medio ambiente, que ejerce la vicepresidencia segunda.
SALVADOR MILÀ SOLSONA, Consejero de Medio Ambiente y Vivienda

• Presidente/a del Institut d’Estudis Catalans, que ejerce la vicepresidencia tercera.
SALVADOR GINER

• Director/a del Instituto de Ciencias del Mar.
Mª DOLORS BLASCO FONT DE RUBINAT

• Director/a del Departamento de Ecología de la Facultad de Biología de la Universidad de Barcelona.
JOAN ARMENGOL

• Director/a del Centro de Búsqueda Ecológica y de Aplicaciones Forestales.
FERRAN RODÓ

• Una persona miembro de la comunidad universitaria o académica catalana.
JAUME TERRADAS

• Una persona miembro de la sociedad civil catalana con mérito reconocido en el ámbito de la ecología y las ciencias ambientales.
JORDI SARGATAL

• Una persona designada por la familia de Ramon Margalef.
RAMON MARGALEF MIR

El Consejo de Dirección está asistido por una Secretaría Técnica, que es la instancia gestora del Premio y ejecuta las decisiones del Consejo de Dirección. Garantiza la buena difusión de la convocatoria anual, recibe las candidaturas, propone la convocatoria del jurado, envía las candidaturas al jurado, asegura la logística de las reuniones y levanta las actas.

• JOHN CELECIA, Ph.D., Especialista Ex-Senior del Programa de la UNESCO Man and the Biosphere (MAB), Profesor de Ecología & Desarrollo Humano Sostenible.